处理公司未完整缴纳社保的问题时，以下特殊情况会影响处理结果：
1. 公司已将生育保险并入职工医保缴纳：部分地区（如北京、上海）已实施生育险与职工医保合并，公司缴纳职工医保即包含生育险待遇。此时若公司仅未缴医保，需补缴医保；若已缴医保，则生育险无需单独补缴，处理重点为确认医保是否正常缴纳。
2. 员工属于“灵活就业人员”身份：若员工与公司签订的是劳务合同而非劳动合同，员工以灵活就业人员身份自行缴纳社保，则公司无强制缴纳五险的义务（仅需为建立劳动关系的员工缴纳）。此时需先确认双方是否存在劳动关系，再判断公司是否需补缴社保。
3. 公司因经营困难申请社保缓缴：若公司已向社保局申请并获批社保缓缴（如疫情期间的缓缴政策），缓缴期间公司仅需缴纳个人部分，单位部分暂缓缴纳，此时员工需核实缓缴审批文件的真实性及缓缴期限，缓缴到期后公司需补缴。
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公司未完整缴纳社保时，员工常因对法律规定不熟悉出现错误操作，以下是常见情形：
1. 忽视社保缴纳记录的核查：部分员工仅通过公司口头告知确认社保缴纳情况，未主动查询官方记录，导致未缴险种长期被隐瞒，错过最佳维权时机（如医保断缴影响就医报销）。
2. 与公司签订“自愿放弃社保协议”：部分员工为短期多拿工资，与公司签订此类协议，但该协议因违反《社会保险法》强制性规定而无效，员工仍需承担社保断缴的风险，且无法免除公司的补缴义务。
3. 直接放弃维权：部分员工认为“三险够用”，未意识到医保、生育险的重要性，放弃要求公司补缴，导致后续生病就医、生育时无法享受法定待遇，造成经济损失。
若您已出现类似错误操作或担心权益受损，可进一步向律师咨询补救措施。
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针对“公司只交三险不算完整社保”的结论，可依据《社会保险法》的核心条款进行法律分析。
根据《中华人民共和国社会保险法》（2018年修正）：
1. 第二条明确“国家建立基本养老保险、基本医疗保险、工伤保险、失业保险、生育保险等社会保险制度”，五险均为法定社保范畴；
2. 第二十三条规定“职工应当参加职工基本医疗保险，由用人单位和职工按照国家规定共同缴纳基本医疗保险费”；
3. 第五十三条规定“职工应当参加生育保险，由用人单位按照国家规定缴纳生育保险费，职工不缴纳生育保险费”（部分地区已将生育保险并入职工医保，但仍需通过医保缴纳实现）。
综上，公司仅缴纳养老、工伤、失业三险，未缴纳医疗（及生育）险，不符合社保法定缴纳要求，属于未完整缴纳社保。
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公司未完整缴纳社保，可能导致以下法律风险：
1. 员工医疗费用无法报销的风险：例如，员工王某所在公司仅缴纳三险，未缴医保，王某因急性阑尾炎住院治疗花费1.2万元，因医保断缴无法报销，全部费用需自行承担，造成直接经济损失。
2. 公司面临行政处罚的风险：例如，某公司未为10名员工缴纳医保，劳动监察部门接到投诉后，依据《社会保险法》第八十六条规定，责令公司补缴医保费及滞纳金，并对公司处以欠缴金额1倍的罚款（共计5万余元），同时影响公司的信用评级。

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